由基因组学北京市重点实验室、病原微生物耐药与耐药基因组学北京市重点实验室、抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室等三家重点实验室共同组成中国科学家团队与美国加州大学戴维斯分校Bart Weimer博士实验室就全球“十万食源性病原微生物基因组计划”共同研发达成合作协议。
“十万食源性病原微生物基因组计划”由美国食品药品监督局支持,全球多家机构合作参与,旨在创建一个包含大多数食源性致病菌的基因组的公共数据库,通过大规模病原基因组研究,获得新方法新技术,以保证食品安全。本次合作中,基因组学北京市重点实验室将完成本计划中部分测序工作;病原微生物耐药与耐药基因组学北京市重点实验室主要进行食源性病原微生物的基因测序与收集工作,同时,以高通量测序技术建立和完善生物信息分析平台;抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室协助建立技术平台和功能实验室。
此次合作在创新技术、人才培养、信息资源共享以及企业成果转化等方面开辟了新思路,是北京市重点实验室打破原有的研发合作模式、探索新型合作模式的重要举措,对于建立中国食源性病原微生物以及生物信息大数据、保障我国的食品安全及生态安全,提升我国基因组研究的学术水平与地位具有重大的现实意义。
背景1:“十万食源性病原微生物基因组计划”简介
“十万食源性病原微生物基因组计划”是由美国食品药品监督局(FDA)支持,美国国立卫生研究院(NIH)、美国农业部(USDA)、美国国家疾控中心(CDC)和欧盟等组织参与,加州大学戴维斯分校(UC Davis)牵头的国际基因组项目。该计划于2013年初启动,旨在创建一个包含大多数食源性致病菌的基因组的公共数据库,通过大规模病原基因组研究,获得新方法新技术,以保证食品安全。
背景2:Bart Weimer教授简介
Bart Weimer教授于2008年起受聘于美国加州大学戴维斯分校,2011年起担任学校基因组测序中心的副主任以及美国国立卫生研究院(NIH)西海岸代谢组学中心整合核心的主任,2013年起担任十万食源性病原微生物基因组计划首席科学家。Weimer教授的主要研究方向是微生物感染、与宿主的关联以及在环境中生存的系统生物学。其课题组通过采用整合的功能基因组学,研究了和生存、感染以及与宿主互动所需要的基因组进化和代谢之间的相互影响作用。
背景3:三家重点实验室简介
北京市重点实验室是首都科技创新体系的重要组成部分,是开展高水平基础研究和应用基础研究、开展学术交流的重要基地,是提升科技攻关能力的重要平台。
病原微生物耐药与耐药基因组学北京市重点实验室依托中国科学院微生物研究所建设,2013年通过认定,重点开展重要病原微生物与免疫生物学的基础与应用基础工作。
基因组学北京市重点实验室依托北京诺赛基因组研究中心有限公司(国家人类基因组北方研究中心)建设,2011年通过认定,旨在整合高通量测序和以“云计算”为基础的生物信息学,打造北京生命科学领域的重大基础平台。
抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室依托北京师范大学生命科学院建设,2011年通过认定,密切围绕“基因资源挖掘与动植物发育”等开展相关基础与应用性研究及相关技术研发。
北京市科委生物医药产业促进中心 产业资讯专报 2014年06月04日 第32期