聂艳丽 黄飞飞
重点实验室韩生成教授课题组在proteomics杂志上发表题为“Identification of inositol 1,4,5-trisphosphate-binding proteins by heparin-agarose affinity purification and LTQ ORBITRAP MS in Oryza sativa”的论文(proteomics 2014,14,2335-2338.)。
IP3是生物体感受外界刺激的重要第二信使之一。在动物细胞中,当外界信号分子与细胞质膜上受体结合后,将激活质膜上的PLC,PKC催化PIP2水解形成IP3和DAG。IP3可与胞内钙库(内质网或液泡)膜上IP3的受体结合,使Ca2+释放到细胞质来传递信号。在动物中已经发现并鉴定了三种类型的IP3受体:IP3R1、IP3R2和IP3R3。它们主要定位于ER膜并具有相似的结构特征:IP3结合结构域、跨膜结构域、耦合结构域和C-端尾巴。IP3R本身是一种由四个亚基组成的钙离子通道,每个亚基都有IP3结合的部位;当3~4个部位被IP3占据时,受体复合物构象发生改变,离子通道被打开,储藏在内质网中的Ca2+释放出来,引起胞内钙离子增加。植物中关于IP3/Ca2+信号通路系统的研究要远远落后于动物细胞。植物学家们利用生物信息学的方法,从蛋白和基因水平上对拟南芥和水稻进行分析,力图找到植物中的IP3受体,但目前仍没有得到植物中IP3受体的有效信息。利用IP3结合实验表明,植物体内存在IP3的结合蛋白,而且主要存在于植物的液泡膜上。然而,到目前还没有关于植物IP3受体的报道。
韩生成课题组为探寻植物中的IP3受体,从水稻悬浮细胞中分离出微粒体组分,利用Heparin可以与IP3竞争结合IP3R的特性,通过Heparin-Agarose亲和纯化获得了IP3结合蛋白。[3H]IP3结合实验确定这些蛋白组分与IP3有特异的结合。进一步利用LTQ ORBITRAP MS技术对这些IP3结合蛋白进行了鉴定,获得了297个蛋白。同时对鉴定得到的蛋白进行GO和跨膜结构域的分析。综上,我们的研究结果首次鉴定得到了植物IP3结合蛋白的数据库,为植物IP3信号通路的研究提供了一定的信息基础。