抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室



2022年06月02日，孙林副教授课题组在International Journal of Molecular Sciences（IF:5.924）上发表题为“Genome-Wide Identification of Long Noncoding RNA and Their Potential Interactors in ISWI Mutants”的研究性文章。2020级硕士研究生张露丹和2020级博士研究生张帅为共同第一作者，孙林副教授为通讯作者，抗性基因资源与分子发育北京市重点实验室为第一完成单位。

长链非编码RNA (Long non-coding RNAs, lncRNAs)被认为是基因表达的关键调控因子，参与了许多重要的生理过程。染色质重塑是一种重要的表观遗传修饰，在许多生命活动中也已被证实。然而，lncRNA在染色质重塑中的调控机制尚不清楚。为了了解果蝇在此过程中全基因组lncRNA的表达情况及其可能的相互作用因子，我们通过转录组分析研究了果蝇中lncRNA和mRNA的表达模式，发现lncRNA和mRNA之间存在着显著差异。然后，我们对果蝇胚胎中具有不同功能的候选lncRNA及其潜在的相互作用因子进行了TSA-FISH实验，以确定它们的表达模式。此外，我们还分析了转座因子(transposable elements, TEs)及其相互作用子的表达，以探讨其在ISWI突变体中的表达。我们的研究结果为理解lncRNAs和TEs在染色质重塑中的可能调控机制及其作用靶点提供了新的视角。

本研究由国家自然科学基金面上项目（NO.31871243和NO.32070566）资助。

全文链接：IJMS | Free Full-Text | Genome-Wide Identification of Long Noncoding RNA and Their Potential Interactors in ISWI Mutants (mdpi.com)

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